<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
<font face="Times New Roman, Times, serif">Debby, <br>
<br>
How were those IEAs obtained? InterPro? Another resource? <br>
</font><br>
Debby Siegele wrote:
<blockquote
 cite="mid:ae00a2b30907241113v19f6c267p154d7b0de5bbfcff@mail.gmail.com"
 type="cite">I have a question about using the 'NOT' qualifier in cases
where an electronic annotation appears to be wrong.&nbsp; The specific case
is I found E. coli proteins (e.g. YbhA and SerB) are annotated to
GO:0015662 'ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions,
phosphorylative mechanism.'&nbsp; I think this electronic annotation was
made because these proteins and P-type ATPases share a common catalytic
domain, but YbhA and SerB aren't membrane proteins and don't have any
of the other conserved domains found in P-type ATPases.&nbsp; How do I
indicate what the 'NOT' is based on?<br>
  <br>
Thanks,<br>
  <br>
Debby <br>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
Go mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Go@geneontology.org">Go@geneontology.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://fafner.stanford.edu/mailman/listinfo/go">http://fafner.stanford.edu/mailman/listinfo/go</a>
  </pre>
</blockquote>
</body>
</html>